Pada tahun 2029, kemajuan dalam Sibernetika memungkinkan orang untuk mengganti hampir semua bagian tubuh dan organ mereka dengan robot. Melalui prosthetics ini, yang lemah menjadi kuat, dan yang sekarat diberi kehidupan baru. Keamanan Publik Bagian 9 Kota Niihama (pengaturan fiksi yang terinspirasi oleh Hong Kong), tim beragam AI, cyborg dan manusia yang tidak dimodifikasi, harus menyelidiki kasus-kasus korupsi dan terorisme. Mayor Motoko Kusanagi memiliki prosthetics seluruh tubuh, karena kecelakaan masa kecil. Dia, yang kedua di perintah Batou dan spesialis informasi Ishikawa telah diberi tugas penting: untuk menyelidiki seorang peretas yang hanya dikenal sebagai & quot; The Puppetmaster. & Quot; Tetapi seperti yang ditemukan Motoko dan timnya, segalanya tidak pernah sesederhana ini.
Ghost in the Shell adalah film thriller futuristik dengan adegan aksi intens yang dicampur dengan rangkaian artistik yang lebih lambat dan banyak pertanyaan filosofis tentang jiwa, gender, dan identitas manusia seseorang dalam era teknologi yang sedemikian canggih.